Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms