Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CABP7Q86V35 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP7Q86V35 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms