Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRRC23Q53EV4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC23Q53EV4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms