Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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