Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms