Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBFBQ13951 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms