Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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