Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP1Q12981 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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