Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms