Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms