Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF4A3P38919 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms