Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms