Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms