Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED5Q9Y3A6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED5Q9Y3A6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms