Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms