Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms