Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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