Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM1

ZNF680, Zinc finger protein 680, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF680Q8NEM1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF680Q8NEM1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF680Q8NEM1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms