Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms