Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms