Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 411.3 ms