Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGER3P43115 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGER3P43115 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGER3P43115 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGER3P43115 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGER3P43115 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGER3P43115 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGER3P43115 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGER3P43115 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGER3P43115 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms