Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPBP14678 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms