Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms