Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC3P02656 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC3P02656 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms