Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA2P02652 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA2P02652 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA2P02652 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA2P02652 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA2P02652 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOA2P02652 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA2P02652 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOA2P02652 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA2P02652 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA2P02652 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA2P02652 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA2P02652 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA2P02652 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA2P02652 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA2P02652 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA2P02652 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA2P02652 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms