Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms