Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATCO43716 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATCO43716 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GATCO43716 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms