Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms