Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF12Q9Y4X4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF12Q9Y4X4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms