Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHTOPQ9Y3Y2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms