Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms