Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABI3Q9P2A4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms