Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms