Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms