Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms