Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms