Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf40Q8WUR7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms