Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms