Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q1

CYB561D1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561D1Q8N8Q1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms