Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms