Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms