Protein–RNA interactions for Protein: Q1AE95

TMEM183B, Transmembrane protein 183B, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM183BQ1AE95 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM183BQ1AE95 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms