Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms