Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPM4P67936 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPM4P67936 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPM4P67936 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPM4P67936 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM4P67936 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM4P67936 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM4P67936 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM4P67936 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM4P67936 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM4P67936 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM4P67936 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM4P67936 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM4P67936 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM4P67936 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM4P67936 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM4P67936 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM4P67936 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM4P67936 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM4P67936 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM4P67936 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM4P67936 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM4P67936 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM4P67936 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM4P67936 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM4P67936 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM4P67936 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM4P67936 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM4P67936 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM4P67936 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM4P67936 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM4P67936 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM4P67936 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM4P67936 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM4P67936 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM4P67936 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM4P67936 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms