Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2H1P32780 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2H1P32780 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2H1P32780 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2H1P32780 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2H1P32780 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms