Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK2P24941 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK2P24941 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK2P24941 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2P24941 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK2P24941 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK2P24941 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK2P24941 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2P24941 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2P24941 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK2P24941 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK2P24941 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK2P24941 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK2P24941 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK2P24941 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK2P24941 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK2P24941 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK2P24941 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK2P24941 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK2P24941 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK2P24941 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK2P24941 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms