Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTMAP06454 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTMAP06454 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTMAP06454 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTMAP06454 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTMAP06454 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTMAP06454 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTMAP06454 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTMAP06454 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTMAP06454 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTMAP06454 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTMAP06454 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTMAP06454 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTMAP06454 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms