Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
POLD1P28340 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLD1P28340 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLD1P28340 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
POLD1P28340 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLD1P28340 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLD1P28340 ZNF43-201ENST00000354959 2881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
POLD1P28340 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 HKR1-201ENST00000324411 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AC004943.1-203ENST00000624370 1074 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 CXCR4-202ENST00000409817 1895 ntAPPRIS P3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLD1P28340 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
POLD1P28340 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
POLD1P28340 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
POLD1P28340 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
POLD1P28340 CXCR4-201ENST00000241393 1682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
POLD1P28340 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
POLD1P28340 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
POLD1P28340 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
POLD1P28340 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
POLD1P28340 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
POLD1P28340 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
POLD1P28340 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms