Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms